NAMD è un software di dinamica molecolare ad alte prestazioni progettato specificamente per simulare sistemi biomolecolari di grandi dimensioni. Eccelle per la sua eccezionale scalabilità, consentendo di sfruttare efficacemente centinaia o migliaia di core. Installato su un server dedicato, beneficia di un ambiente hardware ottimizzato e non condiviso, ideale per calcoli distribuiti impegnativi. Questa configurazione garantisce simulazioni più rapide, stabili e perfettamente adattate alle esigenze avanzate di modellazione.