O NAMD é um software de dinâmica molecular de alto desempenho especialmente concebido para simular sistemas biomoleculares de grandes dimensões. Ele destaca-se pela sua escalabilidade excecional, permitindo explorar eficazmente centenas ou milhares de cores. Instalado num servidor dedicado, beneficia de um ambiente de hardware otimizado e não partilhado, ideal para cálculos distribuídos exigentes. Esta configuração garante simulações mais rápidas, estáveis e perfeitamente adaptadas às necessidades avançadas de modelização.