High Performance Computingimage use case Namd

NAMD est un logiciel de dynamique moléculaire hautes performances spécialement conçu pour simuler des systèmes biomoléculaires de très grande taille. Il excelle par sa scalabilité exceptionnelle, permettant d'exploiter efficacement des centaines ou milliers de cœurs. Installé sur un serveur dédié, il profite d'un environnement matériel optimisé et non partagé, idéal pour des calculs distribués exigeants. Cette configuration garantit des simulations plus rapides, stables et parfaitement adaptées aux besoins avancés de modélisation.

Serveurs testés par des experts et recommandés pour les charges de travail sur NAMD

5,0

Namd-Adapted Score

Minimal

SCALE-a5

420 339 CFA

HT/mois

or 496 000 CFA incl. VAT/month

Setup fee: 420 339 CFA

Order

Processeur: AMD EPYC 9555

Coeurs / Threads: 64c / 128t

Fréquence: 3.2GHz / 4.4GHz

RAM: 128GB DDR5 ECC 4800MHz

4,9

Namd-Adapted Score

Recommended

HGR-HCI-i4

794 068 CFA

HT/mois

or 937 000 CFA incl. VAT/month

Setup fee: 794 068 CFA

Order

Processeur: Intel Xeon Gold 6554S

Coeurs / Threads: 36c / 72t

Fréquence: 2.2GHz / 3GHz

RAM: 256GB DDR5 ECC 4800MHz

4,3

Namd-Adapted Score

Best

SCALE-a4

361 017 CFA

HT/mois

or 426 000 CFA incl. VAT/month

Setup fee: 361 017 CFA

Order

Processeur: AMD EPYC 9455

Coeurs / Threads: 48c / 96t

Fréquence: 3.15GHz / 4.4GHz

RAM: 128GB DDR5 ECC 4800MHz

4,2

Namd-Adapted Score

Better

HGR-HCI-a2

836 864 CFA

HT/mois

or 987 500 CFA incl. VAT/month

Setup fee: 836 864 CFA

Order

Processeur: AMD Epyc 9354

Coeurs / Threads: 32c / 64t

Fréquence: 3.25GHz / 3.8GHz

RAM: 384GB DDR5 ECC 4800MHz

ATPase
STMV

5,0

Namd-Adapted Score

Minimal

SCALE-a5

420 339 CFA

HT/mois

or 496 000 CFA incl. VAT/month

Setup fee: 420 339 CFA

Order

Processeur: AMD EPYC 9555

Coeurs / Threads: 64c / 128t

Fréquence: 3.2GHz / 4.4GHz

RAM: 128GB DDR5 ECC 4800MHz

4,9

Namd-Adapted Score

Recommended

HGR-HCI-i4

794 068 CFA

HT/mois

or 937 000 CFA incl. VAT/month

Setup fee: 794 068 CFA

Order

Processeur: Intel Xeon Gold 6554S

Coeurs / Threads: 36c / 72t

Fréquence: 2.2GHz / 3GHz

RAM: 256GB DDR5 ECC 4800MHz

4,3

Namd-Adapted Score

Best

SCALE-a4

361 017 CFA

HT/mois

or 426 000 CFA incl. VAT/month

Setup fee: 361 017 CFA

Order

Processeur: AMD EPYC 9455

Coeurs / Threads: 48c / 96t

Fréquence: 3.15GHz / 4.4GHz

RAM: 128GB DDR5 ECC 4800MHz

4,2

Namd-Adapted Score

Better

HGR-HCI-a2

836 864 CFA

HT/mois

or 987 500 CFA incl. VAT/month

Setup fee: 836 864 CFA

Order

Processeur: AMD Epyc 9354

Coeurs / Threads: 32c / 64t

Fréquence: 3.25GHz / 3.8GHz

RAM: 384GB DDR5 ECC 4800MHz

Metric

MetricMinimum RequirementBest Requirement
ATPase
111
STMV
03

Weighting of metrics in the score calculation

Adapted Score
ATPase50,00%
STMV50,00%
ATPase50,00%
STMV50,00%

Score scale from 0 to 5 to evaluate server adequacy

5.04.33.40
Ideal zone

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